در این مطالعه ماهیان 8 رشته قنات در تفت و مهریز استان یزد با استفاده از توالی ژن COI در مقایسه با نمونه های متعلق به رودخانه های سیروان، کارون، مند، کر، حوضه کرمان و حوضه نمک مورد بررسی قرار گرفتند. گونه های Capoeta saadi و .Cyprinion sp در قنات های مورد مطالعه مشاهده شدند. تنوع هاپلوتایپی در قنات ها صفر بود. هاپلوتایپ ماهیان C. saadi قنات های مورد مطالعه با هاپلوتایپ متعلق به حوضه کر یکسان بود. هاپلوتایپ .Cyprinion sp با هاپلوتایپ های گونه های Cyprinion watsoni و Cyprinion macrostomum حوضه های مند و کارون فاصله ژنتیکی قابل توجهی (1.94-1.68 درصد) داشت. در بررسی های شجره شناسی، جنس Capoeta یک گروه تک شجره ای را تشکیل داد که جنس های Luciobarbus، Barbus نسبت به آن اجدادی بودند و بر پایه اطلاعات به دست آمده جنس Cyprinion نسبت به سایر جنس های مورد مطالعه قدیمی تر است که شاید با سطح پلوئیدی آن (دیپلوئید) در مقایسه با سایر جنس ها قابل توجیه باشد.